Whole genome sequencing ermöglichen könnte, personalisierte Behandlung von Krebs, Studie legt nahe,

Ganz-Genom-Sequenzierung von Tumor-Zellen könnte helfen, vorherzusagen, die Prognose des Patienten ist Krebs und bieten Ansatzpunkte zu identifizieren, die effektivste Behandlung, schlägt vor, eine internationale Studie, die heute veröffentlicht in Nature Medicine.

Unsere DNA, das menschliche Genom, besteht aus einer Reihe von Molekülen bekannt als Nukleotide. Diese werden vertreten durch die Buchstaben A, C, G und T. Manchmal, änderungen in der ‚Rechtschreibung‘ der DNA—Ein a wird G, zum Beispiel. Diese änderungen, bekannt als Mutationen verursacht, kann durch eine Anzahl von Faktoren, einige spontan, andere Umwelt, wie etwa die Exposition gegenüber Tabakrauch oder UV-Licht, und alle hinterlassen charakteristische Signaturen auf dem Genom.

Wie Zellen teilen und zu vermehren, machen Sie Kopien Ihrer DNA, also Rechtschreibfehler vervielfältigt werden. Im Laufe der Zeit, die Anzahl der Fehler häuft sich, was zu unkontrolliertem Zellwachstum—die Entwicklung von Tumoren.

Whole genome sequencing (WGS) ist eine Technik, die beinhaltet das Lesen der gesamten genetischen bauplan der Krebszellen und der Vergleich zu einem Patienten gesunde Zellen, um zu sehen, wie sich die DNA mutiert. Durch das Studium alle Mutationen vorhanden in eine ganze Krebs genome und die Suche nach all den Unterschriften, die in Ihnen ist es möglich zu ermitteln, die verschiedenen Faktoren, die gehandelt haben, die auf den Tumor.

Um zu verstehen, ob WGS, könnte nützlich sein, in einer klinischen Einstellung, Cambridge-Forscher gemeinsam mit Kollegen in Schweden ausgeführt einer Bevölkerung-weiten Projekt namens SCAN-B, wurde die Rekrutierung aller Frauen mit Brustkrebs diagnostiziert, im Süden von Schweden seit 2010. Dies war kritisch, da SCAN-B hat eine große Menge von klinischen outcome-Daten.

Diese internationale Zusammenarbeit von Forschern verwendet WGS zu analysieren Tumoren von Patienten, die diagnostiziert worden war, dass triple-negativem Brustkrebs. Diese Krebsarten sind so genannt, weil Sie die fehlenden drei Schlüssel-Moleküle, sogenannte Rezeptoren. Sie machen rund 9% der Brustkrebsfälle, die in Zusammenhang stehen mit schlechteren Ergebnissen. Sie sind auch häufiger bei Frauen mit afrikanischen und asiatischen Vorfahren.

„Whole genome sequencing gibt uns einen vollständigen überblick über die Krebs-Genom. Es zeigt viele Dinge, die wir nicht sehen konnte bisher, weil wir einfach nicht nach Ihnen suchen,“ sagt Dr. Serena Nik-Zainal, von der Medical Research Council Cancer Unit an der Universität Cambridge, die die Studie leitete.

„Mit einem umfassenden Krebs-Genom-Zuordnung für jeden Patienten hilft uns zu verstehen, was verursacht hat, jeder patient ist ein Tumor und Behandlung jedes einzelnen effektiver zu gestalten. Zuvor war es wie das gehen auf eine Reise mit nur einer begrenzten Karte, aber jetzt, mit gesamte Genom-Sequenzierung haben wir eine viel bessere, detailliertere Karte und wissen, der beste Weg um unser Ziel zu erreichen.“

Die Forscher verwendeten einen machine-learning-Algorithmus genannt HRDetect, denen Sie bereits entwickelt, um zu identifizieren, Tumore mit Signaturen, verursacht durch Mutationen in den BRCA1-oder BRCA2-Gene. Mit einer Variante einem der beiden Gene erhöht das individuelle Risiko der Entwicklung von Brustkrebs und eine relativ neue Klasse von anti-Krebs-Medikament namens PARP-Inhibitoren, die entwickelt wurden speziell für diese Tumoren. HRDetect erzielt hatte zuvor vorgeschlagen, dass ein größerer Anteil von Frauen in der Allgemeinen Bevölkerung haben könnte, Tumoren, sind sehr ähnlich den BRCA1/BRCA2-mutierten Tumoren.

Unter der souverän, das team einteilen, jeden Patienten als entweder hohe, mittlere oder niedrige Wertung.

Patienten, die punkteten, waren diejenigen, die hatten die besten Ergebnisse mit aktuellen Behandlungen für triple-negativen Brustkrebs—Sie sind auch wahrscheinlich, um zu reagieren PARP-Inhibitoren.

Überraschend, mittlerem erzielt hatte, den ärmsten Ergebnisse. Aktuelle triple-negativen Brustkrebs-Behandlungen hatte Effektivität eingeschränkt was darauf hindeutet, dass neue Ansätze notwendig wäre zur Bewältigung dieser Krebserkrankungen. Jedoch, die genetische Veränderungen und Signaturen offenbart durch WGS gab Hinweise auf die Mechanismen, die fahren diese Tumoren, die wiederum kann helfen, informieren Sie über die Entwicklung neuer Medikamente.

Patienten mit niedrigen Punktzahlen haben auch schlechte Ergebnisse, obwohl nicht so stark, wie diejenigen, die in die mittlere Gruppe. Aber die WGS-Profil in einigen dieser Tumoren vorgeschlagen biologischen Anomalien, die möglicherweise anvisiert werden, die durch vorhandene Medikamente oder Drogen, die derzeit in klinischen Studien, wie sogenannte checkpoint-Inhibitoren oder AKT-Hemmer.

„Using whole genome sequencing, wir können wirklich unterscheiden, Tumoren, die möglicherweise oder möglicherweise nicht auf aktuellen Drogen unter triple-negativen Brustkrebs-Patientinnen, eine Art von Brustkrebs, die wir immer noch kämpfen, um zu behandeln, naja,“ sagt ersten Autor Dr. Johan Staaf aus der Abteilung für Klinische Wissenschaften, Universität Lund, Schweden.

„Wichtig ist jedoch, dass dieser Ansatz gibt uns auch Hinweise auf einige der Mechanismen, die schief gelaufen sind in den Armen-Ergebnis Tumoren, und damit, wie wir behandeln diese Tumore anders oder wie könnten wir die Entwicklung neuer Medikamente.“

Die Geschwindigkeit der Sequenzierung Technologie Fortgeschritten ist, so dass WGS durchgeführt werden kann in 24 Stunden, mit einem anderen 24-48 Stunden für die Analyse der Daten. In der Theorie, daher sollte es möglich sein, bieten ganze Genom-screening als selbstverständlich für alle Patienten, so dass eine persönliche Auslesen von Ihrem Tumor und mögliche Behandlungsoptionen.

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